>Osa02LNT0157300.1

ATTTTTTTCTTAAAAAAAATCATAGCTGCCAAACACCACCTTATTACAGAGTCACTTATTAGGTATACACGCATGCACCGCTCAGTTATTAGTAATGAAACAAAGCATATCCAGAGACCACCTTATTACAGAGTCCCAATTCCCTTATGGGGAGTCATCCTTACCAAAAAAAAAAAAAGAAATATCGTGGCTGCATGGAAAATAGAACCTTCATTTCAGGATTTGCAGCATCGGCAGGTTTGGCAATGTTTTTTTTCTTTTTGAGGTTTGGCAATGATTTTTAGAGTGACCATATAAGCTGCTACTGACATCGTAACAGTTAAAGCGAAATGTGCCAGCTTCGAAGCCTTGATAGATTTGGCTCGGATGGCTGCAGCTATCTCGGCATTACGGGATTCCACACAATGTGGGCACTTCGTGGTTGTACTGGACGAGTAAGTTTGCTTGGCCCCTCCAAACGGATTTGCAAATGCAACCTTCCCGTGATTGCAATCAACAGAGGATGTCGCAGTTTTTGCGCAGGTCATTTTATCACTTGAATAAGGGCATATTTTGCTGTTAAAGTACCTTGCAGCCTTTTTTTTAATGTTTGATAAAATGGGATGCGTCACCTACGGATGGACCAACGGATTGTTGGTCGTTGGTATAGCAATATCAATATTATTATGGCTCTTAGTTGAC

Explanation	CPC Score
noncoding	-1.02981

Transcript ID	Chromosome	Locus	Ref	Alt
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Osa02LNT0157300.1	2	10800266	G	A

Transcript ID	Transposon ID	Chromosome	Strand	Start	End	Counts

Transcript ID	MiRNA ID	Inhibition	Expectation	Score	Binding Start	Binding End
Osa02LNT0157300.1	osa-miR1437b-5p	Cleavage	4.5	22.581	1	21
Osa02LNT0157300.1	osa-miR2094-3p	Cleavage	5.0	19.393	1	22

Transcript ID	Chr	QTL Gene	Character Major	Character Minor	Marker Interval1	Marker Interval2
Osa02LNT0157300.1	2	qLRS-2	Resistance or Tolerance	Drought tolerance	RM322	RM324
Osa02LNT0157300.1	2	nan	Resistance or Tolerance	Drought tolerance	RG83	RG171
Osa02LNT0157300.1	2	qPH-2	Morphological trait	Dwarf	RG324	RG83

Transcript ID	Pre-miRNA	Identity(%)	Alignment Length	Pre-miRNA start	Pre-miRNA end	E-value	Bitscore

Transcript ID	Chromosome	Locus	Trait	Value	Plus Minus