>Osa02LNT0165800.1

AAAGCAGATAAACATTGCTACGATTCAGATCGTCAAGATGCCAGTAACAACCTTACCTTTCCTCCCTATAAATTACAGTACAAAACAAAGGCAACATCTCAAATCAATAACGGTTTCTGACCGAACTTCAGAACCGGGGGTTTACAAAAGAATCGAATTGCCAATTAATGATCCCTAAGCCAATCTGTACAATATCCCCATAAAAATGTCACCTTCTCCTCTCTCTCCCCTGCTGTAAATTATTTCACACTCTACGTGACTCCGAACAACCTGAATTCCTACGCTTAATTAGCGTTACATATAGGAGTACTAGTATCTTATTCATATACTGTATATGCCTGGCTATAGCTTGTCGGCGATCCGGCCGAGCGCGTCGGCGAGCCGGCCGAGCACGACGGCGAGGCTGGCCGCCTGGTCTCGCCGCTGCTCCCGGTCGAGCCGGCTGTTGGCGTTCTGCGCCTCCAGCTGCGCCGCCACCATCCGGCTGCTCCGATCCAGGATCTCCACCAGCTTGCTCTGCAGCTCGCCGCCGCGGCGGCCGTCGTCCTCCTCCTCCTCGTCGTCGTCGGCTCGCCGCCGCTTCTGCCCACCCTGCTGCTGCTGCGTCGTCGGCGGCGGCGGCGGTGGCGTGCCTCTCGATGCGGCCTGCTGCTCCGGCTGCTTGTCTTTCGACGTGCCGGATATCGGCAAGGCGATCACCGCTCGAGGCGGCGCCTGTGCCGTCGCAGCGACGGCGGCGGCGGTCGCCGGCGGCGCCTCGTCGTCGTCCTCCTCCTCCTCGTCGTCGGAGAACAGCGACTCTTCCGCGGCGGGGCGGCCACTGTCGAACACCGTCTCCTCGGCTCGGGCTCGCGTCTTCCCCGTCTCCTCCTCCTCCTCCACCTCCACCTCCACCTCCGCCGCCGCGCGCGCGGGCTCCTCTTCCCCCGCCGCGGCATTACCTCCTCCGGAGGGGGAGACGAGGGTGCCGCGCCCCCGGCCGTCGAGTATGTCGTACACCTCCCGGTCGAAGAACCCCGGGAGCCGGCGCTCCCGCCGCGCGTCGTTCCGCATGGCCCAGAACGACGGCTCCCGCGGCGGCGCCGCCGCCGCCGCCGCGCGCTCCCACTCCTTGATCTTCTTGTAGTCCCCGGCGAGGTTGCTCCACCGCTTCCTGCACTGCACGGCGCCCCTCTCCACGCCGTGCCGCCGGCAGTACTCCGCCACCGCCGCCCACTTGGGCTCCAGCGCCGCCACCGC

Explanation	CPC Score
noncoding (weak)	-0.360908

Transcript ID	Chromosome	Locus	Ref	Alt
Osa02LNT0165800.1	2	18658217	C	G
Osa02LNT0165800.1	2	18658969	T	C
Osa02LNT0165800.1	2	18658973	G	T
Osa02LNT0165800.1	2	18659085	T	C
Osa02LNT0165800.1	2	18659158	T	C
Osa02LNT0165800.1	2	18659184	G	A
Osa02LNT0165800.1	2	18659212	A	G
Osa02LNT0165800.1	2	18659361	A	G
Osa02LNT0165800.1	2	18659401	A	G
Osa02LNT0165800.1	2	18659424	A	G
Osa02LNT0165800.1	2	18659571	T	C
Osa02LNT0165800.1	2	18660218	A	C
Osa02LNT0165800.1	2	18660236	C	T
Osa02LNT0165800.1	2	18660629	T	C
Osa02LNT0165800.1	2	18661002	A	C
Osa02LNT0165800.1	2	18661327	C	A

Transcript ID	Transposon ID	Chromosome	Strand	Start	End	Counts

Transcript ID	MiRNA ID	Inhibition	Expectation	Score	Binding Start	Binding End
Osa02LNT0165800.1	osa-miR5809	Translation	5.0	13.651	1	20

Transcript ID	Chr	QTL Gene	Character Major	Character Minor	Marker Interval1	Marker Interval2
Osa02LNT0165800.1	2	np2.2	Morphological trait	Culm/leaf	RM324	RM262
Osa02LNT0165800.1	2	qSS-2	Physiological trait	Sterility	RM301	RM263
Osa02LNT0165800.1	2	2-3SY	Physiological trait	Source activity	RG171	RG157
Osa02LNT0165800.1	2	qPH-2	Morphological trait	Dwarf	RG324	RG83
Osa02LNT0165800.1	2	nan	Morphological trait	Root	RG171	RG157

Transcript ID	Pre-miRNA	Identity(%)	Alignment Length	Pre-miRNA start	Pre-miRNA end	E-value	Bitscore

Transcript ID	Chromosome	Locus	Trait	Value	Plus Minus