>Osa10LNT0075300.1

GCGCGGAGTCTCTTCTCTCGCGCGCAACCAATGTTGGGCGCCGCCGCGCCTCCTCCTCCGGCGAGACGCGCCACCGCCGGGACTCCTCCGGCGAGACACCACCAGCACTGCCACCGTACTAGGCTTCTCTAGAACAGCCACCGTCAATCTTGCTCCCACCTGAAGCAACACGACGCGCTCTCTCCAGTGGCAGTGCGCCAGTGCCCCATCCCCCAGGTCAACCTCGATAGCCACCAAGAGCGGTTCTCCAGTGGCCGTCACTAAGCATCGCCAGCACCGTGACTCAGTTCGACTGGTTCATATGCTTTAACACATAAGCTACGTGGTAAATTAAACAACATTGATTAAGAAGGGAACACACGCGTTCACTGCTTCGACAGATCAACTACAAGAATTGTCAAGTATGCCTCCTTGTACTTCCTCTCTTGCCATAATTTAATTTAAATTTAATACGCAATTTGCAAAGGGTTATTGTACTTTAGCATGCACTGGTATGTAAACCTCAACTTCTTCACTCAAGATTACTATTTAGTTTTTTTTCTCTGCTCCGTTTGGTTTCCCTTTTCTCATCTCTAGCTCTAGTTTTACCATGATTCTGTGAAATGAATATTTTTAGATCTAACAGAGAATCTTTTTTTACTGGACAGAGAATCATTTTTGCTGGAGTTATTAGGAACATTTTATGTTTAGCAATAGTATATGTTCTGATATCTTCATGAAATTCATTATTAAACTGACAACAACCCTTCAAAGCTGAACACTATATCGCTCATCCATTAGACCAGCTAATGCTACTACTATTTTTTTTTCTGAGGAGCCAAATTGCTGCATAGGTATGTCTGATGGCCCTACAATTTAACTTGAAAGCTCTGCTATTTGTATACTTGATTCAATTTCAGCAGATGTAAATTTTACAACTCTTTGTATTCAGTTAATCTGGTTTAATTCTTCTCTATTCTTGATGGTCCTAGCTTAGCTTAATTCTGATTAATTATTGTAGTCTCTGTCAGGGAACCGTATAATTAGTGATTAATTTAGCATGCATGTGAGACTAAATAAATGGTAAAAAACAGATTTTTGATAGGACCTCGCTGGCCAAACAAAGTGACCTAGTAGTACTAATTAATTAAAACAACAACTACTACTACTAATTAGTACTGCTAAGTGCTAACCATAACTATCTACACTAATGACAGTGTTTGTGTGCTTGCTTGGGGGCATAAAACTAAGAGACAGAGTTAGCTGGAGATGGCCACGGTCCGTCTGAAGCATTGCGCATTAATTTGCATCTCAAACTGTAGTAGCATGAGGCTTTAATCTGTCTAATCAGTTTGCACCTAAACAGCAGCTCAATGGCACTGCAGTTCAGCTGAAAATGTTGCAAAAGTTTACCTAATGAGGACTCACATAGGGGGTATATATATGAGATGCACTTCTTTTCCTTGTCATGTCCATAATGATAATTGTCCTCTTGCACTCTTCCTCTTGCCATGATTCAATTTGAATCTCTGGATTGGCATAAACAAGGATTGTCCCACACAGAGCTATACTCTAGTCTGCATTTTCTATACAAGAAGTACTTGAATGATTTTTTTTCTACCAACGCTACAGGTTGCACCCTTACTTGTGTTTTTAATTCTTGGATGTAGGCAACAGGCCTTGCCCTTGTATATTCAGCCTTGTTCTCAATTTGGAGCAGCGATGGAGATAGTTGATGCTTATGAATGCAGGAGGAAAACACATCCAAGATATTTGTAAATGATAATTGTATGATTATATCTTGTATTTGCTGAAAGTGATATTTCTTGGATGCTCATATAATACTTGGCTAAATACTGTAGATGGTAGCTCAATTTGATCATCTCATGAATTAAGTTGATGCTTGTATCTATAATGTTCTCTATTTTACCTAGAATTTATTGCTCTAATTGGAGTTC

Explanation	CPC Score
noncoding	-1.23191

Transcript ID	Chromosome	Locus	Ref	Alt
Osa10LNT0075300.1	10	18642326	T	C
Osa10LNT0075300.1	10	18643936	A	G
Osa10LNT0075300.1	10	18644623	A	G

Transcript ID	Transposon ID	Chromosome	Strand	Start	End	Counts

Transcript ID	MiRNA ID	Inhibition	Expectation	Score	Binding Start	Binding End
Osa10LNT0075300.1	osa-miR5526	Cleavage	5.0	10.27	1	21
Osa10LNT0075300.1	osa-miR5536	Translation	5.0	14.729	1	22
Osa10LNT0075300.1	osa-miR395x	Cleavage	5.0	18.284	1	21
Osa10LNT0075300.1	osa-miR3981-5p	Translation	4.0	14.55	1	21
Osa10LNT0075300.1	osa-miR5083	Translation	3.5	16.111	1	20
Osa10LNT0075300.1	osa-miR5515	Cleavage	4.5	20.61	1	21

Transcript ID	Chr	QTL Gene	Character Major	Character Minor	Marker Interval1	Marker Interval2
Osa10LNT0075300.1	10	qRf-10-2	Physiological trait	Sterility	RM258	RZ811
Osa10LNT0075300.1	10	Rf	Physiological trait	Sterility	nan	nan
Osa10LNT0075300.1	10	nan	Physiological trait	Sterility	C701	C16
Osa10LNT0075300.1	10	ssd10	Morphological trait	Panicle/flower	RG257	RZ583
Osa10LNT0075300.1	10	nan	Resistance or Tolerance	Drought tolerance	RZ892	BCD386

Transcript ID	Pre-miRNA	Identity(%)	Alignment Length	Pre-miRNA start	Pre-miRNA end	E-value	Bitscore

Transcript ID	Chromosome	Locus	Trait	Value	Plus Minus